Sistem rak shuttle bekerja menggunakan konfigurasi FIFO (first-in, first-out) atau konfigurasi LIFO (last-in, first-out). Konfigurasi yang digunakan akan bergantung pada apakah ada akses dari kedua ujung lorong atau hanya satu ujung.
Sistem rak shuttle dioperasikan menggunakan kendali jarak jauh, sinyal radio, atau WiFi.
Operator manusia cukup mengirimkan pesanan ke shuttle, yang kemudian mengambil palet penuh dan mengangkutnya, menggunakan rel terintegrasi, ke ruang berikutnya yang tersedia di rak. Rel vertikal di ujung lorong juga memungkinkan shuttle bergerak naik dan turun tingkat sehingga tidak ada ruang yang terbuang sia-sia.